Att använda biodiesel i en bil kan kräva vissa justeringar eller kompatibilitetskontroller. Äldre dieselmotorer kan behöva modifieras för att tillgodose biodieselns olika egenskaper och smörjegenskaper. Moderna dieselfordon är dock i allmänhet kompatibla med biodieselblandningar upp till en viss procentandel, enligt tillverkaren. Se alltid din bils bruksanvisning eller rådfråga en expert innan du använder biodiesel för att säkerställa kompatibilitet och undvika eventuella problem.
