CNG-bilar har ett separat bränslesystem som inkluderar en CNG-tank, en tryckregulator och en bränsleinsprutare. CNG-tanken lagrar den komprimerade naturgasen under högt tryck. När motorn behöver bränsle minskar tryckregulatorn trycket på CNG och bränsleinsprutaren sprutar in det i motorns cylindrar, där det blandas med luft och antänds för att producera förbränning och driva fordonet.
Bensinbilar har däremot ett bränslesystem som är designat för bensin. Bensin lagras i en bränsletank och pumpas genom en bränsleledning till motorns bränsleinsprutare. Bränsleinsprutaren sprutar bensin in i motorns cylindrar, där den blandas med luft och antänds för att producera förbränning och driva fordonet.
Även om det inte är möjligt för CNG-bilar att köra på bensin utan betydande modifieringar, finns vissa bi-fuel-fordon tillgängliga som kan köras på både CNG och bensin. Dessa fordon har två separata bränslesystem och kan växla mellan bränslen beroende på tillgänglighet eller preferenser.